Kākāpō Papegøje: Genomisk sekventering fordele Bevaringsprogram

Kākāpō papegøje (også kendt som "ugle papegøje” på grund af dets uglelignende ansigtstræk) er en kritisk truet papegøjeart hjemmehørende i New Zealand. Det er et usædvanligt dyr, for det er de længstlevende fugle i verden (kan leve op til 90 år). Med en vægt på omkring 3-4 kg er den også den tungeste, eneste flyveløse og natlige papegøje i world.  

Kākāpō har beboet New Zealand siden deres udvikling i isolation men deres befolkning faldt hurtigt. I 1970'erne var der kun 18 mandlige kākāpō kendt for at eksistere. Eksistensen af ​​kvindelige Kākāpō blev bekræftet i 1980. Takket være intensiv bevaringsforvaltning er Kākāpō papegøjer blevet bragt fra randen af ​​udryddelse. Deres antal var 51 i 1995. I dag er 247 kākāpō i live^1,2.  

For at hjælpe med bevarelse opstod Kākāpō125+-projektet i 2015 for at sekventere genomerne fra 125 levende kākāpō plus nogle vigtige nyligt afdøde individer. Ideen var at forbedre den genetiske håndtering af kākāpō, især for at imødegå lavt reproduktivt output (infertilitet) og sygdom, der hindrede genopretning. Den fulde samling på kromosomniveau af referencegenomet for en individuel kākāpō blev afsluttet i 2018³.  

I en undersøgelse offentliggjort den 29^th August 2023 har forskerholdet rapporteret sekventering af genomerne af næsten hele kākāpō-populationen (fra 2018) på 169 kākāpō fra 125 levende individer og 44 lagrede prøver. Data på populationsniveau knytter genetisk diversitet på tværs af arten til specifikke DNA-sekvenser knyttet til egenskaber såsom sygdomsmodtagelighed, kyllingevækst osv. Dette kunne hjælpe med at identificere sundhedsrisici tidligere for at planlægge behandling tilpasset individuelle kākāpō fugle. Denne tilgang til at identificere specifikke genetiske egenskaber, der er afgørende for overlevelse, kunne bruges til at håndtere bevarelse af andre truede arter^4,5.  

*** 

Referencer:  

1. Institut for Bevaring. regering i NZ. Kākāpō Recovery. Tilgængelig kl  https://www.doc.govt.nz/our-work/kakapo-recovery/ 

2. Naturhistorisk Museum. New Zealands skæve kākāpō er trukket tilbage fra udryddelseskanten. https://www.nhm.ac.uk/discover/new-zealands-quirky-kakapo-are-pulled-back-from-extinction.html 

3. Institut for Bevaring. regering i NZ. Kākāpō125+ gensekventering https://www.doc.govt.nz/our-work/kakapo-recovery/what-we-do/research-for-the-future/kakapo125-gene-sequencing/ 

4. University of Otago 2023. Nyheder – Redder arter fra udryddelse – højkvalitets kākāpō-populationssekvensering giver gennembrud i forståelsen af ​​nøglebevaringsgenetik. Tilgængelig kl https://www.otago.ac.nz/news/otago0247128.html Besøgt den 29. august 2023.  

5. Guhlin, J., Le Lec, MF, Wold, J. et al. Artsdækkende genomik af kākāpō giver værktøjer til at fremskynde genopretning. Nat Ecol Evol (2023). https://doi.org/10.1038/s41559-023-02165-y  Fortryk på bioRxiv doi: https://doi.org/10.1101/2022.10.22.513130  

***