Tmesipteris oblanceolata, en type gaffel bregne hjemmehørende i Ny Kaledonien i det sydvestlige Stillehav har vist sig at have en genomstørrelse på 160.45 Gigabasepar (Gbp)/IC (1C = nuklear DNA-indhold i en gametisk kerne). Dette er omkring 7 % større end Paris japonica (148.89 Gbp/1C), en japansk plante, der havde haft denne rekord siden 2010. Til sammenligning er den menneskelige genomstørrelse 3.1 Gbp/1C (dvs. 3.1 milliarder basepar pr. gametisk kerne ). Således er genomet af T. oblanceolata er omkring 50 gange større end menneskets genom.
Bregnerne tilhørende Tmesipteris blev anset for at have gigantiske genomer baseret på indikationer fra tidligere undersøgelser. Det tog imidlertid forskerne omkring et årti med udforskning af mangfoldigheden af genomstørrelser blandt planter at nå frem til det aktuelle fund om den faktiske genomstørrelse af T. oblanceolata
Der er ekstraordinær variation i genomstørrelser på omkring 20,000 eukaryote organismer, der er undersøgt indtil videre. Af disse har kun få planter og dyregrupper genomer større end 100 Gbp. Lungefisk (Protopterus aethiopicus) ved 129.90 Gbp, og flodsalamander (Necturus lewisi) ved 117.47 Gbp er eksempler fra dyregrupper. Den europæiske mistelten (Viscum album) med 100.84 Gbp er et eksempel fra planteriget. Interessant nok findes seks af de største eukaryote genomer blandt planterne.
Større genomstørrelse betyder ikke nødvendigvis større antal gener. Gentagne transposerbare elementer kan tegne sig for store genomstørrelser.
***
Referencer:
- Fernandez, P. et al. Et 160 Gbp gaffelbregne-genom smadrer størrelsesrekord for eukaryoter. iScience. Udgivet 31. maj 2024. DOI: https://doi.org/10.1016/j.isci.2024.109889
- Institut Botànic de Barcelona 2024. Forskningsnyheder – Det største genom på planeten er blevet opdaget i en bregne. Opslået 31. maj 2024. Tilgængelig på https://www.ibb.csic.es/en/2024/05/the-largest-genome-on-the-planet-has-been-discovered-in-a-fern/
***
/IC (1C = nuclear DNA content in a gametic nucleus). This is about 7% larger than that of Paris japonica (148.89 Gbp/1C), a Japanese plant that had held this record since 2010. For comparison, human genome size is 3.1 Gbp/1C (i.e., 3.1 billion base pairs per gametic nucleus). Thus, the genome of T. oblanceolata is about 50 times bigger than human genome. ){kind=link}